Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCM1Q15154 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms