Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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BRD3Q15059 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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BRD3Q15059 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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BRD3Q15059 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
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BRD3Q15059 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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