Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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CAPSQ13938 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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CAPSQ13938 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
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CAPSQ13938 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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CAPSQ13938 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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CAPSQ13938 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
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CAPSQ13938 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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