Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SHROOM2Q13796 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHROOM2Q13796 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms