Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP1A4Q13733 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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