Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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