Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPM6BQ13491 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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