Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PMS2P3Q13401 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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PMS2P3Q13401 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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PMS2P3Q13401 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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PMS2P3Q13401 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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