Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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