Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK3Q13003 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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