Protein–RNA interactions for Protein: Q12952

FOXL1, Forkhead box protein L1, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXL1Q12952 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FOXL1Q12952 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms