Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
AP1B1Q10567 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP1B1Q10567 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms