Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC173Q0VFZ6 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms