Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms