Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNG1Q06432 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms