Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms