Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSC2Q02487 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms