Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms