Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms