Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHMP4BP1P59074 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHMP4BP1P59074 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHMP4BP1P59074 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHMP4BP1P59074 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHMP4BP1P59074 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHMP4BP1P59074 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHMP4BP1P59074 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHMP4BP1P59074 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHMP4BP1P59074 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHMP4BP1P59074 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHMP4BP1P59074 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CHMP4BP1P59074 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHMP4BP1P59074 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHMP4BP1P59074 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHMP4BP1P59074 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHMP4BP1P59074 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms