Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RANGAP1P46060 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms