Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM5CP41229 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms