Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms