Protein–RNA interactions for Protein: P29320

EPHA3, Ephrin type-A receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA3P29320 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms