Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms