Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSFA2P28290 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms