Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB4P28070 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms