Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms