Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYT1P21579 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYT1P21579 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT1P21579 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT1P21579 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT1P21579 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT1P21579 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT1P21579 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT1P21579 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT1P21579 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT1P21579 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT1P21579 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT1P21579 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT1P21579 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT1P21579 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT1P21579 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT1P21579 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT1P21579 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT1P21579 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT1P21579 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT1P21579 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT1P21579 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT1P21579 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT1P21579 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT1P21579 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT1P21579 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT1P21579 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT1P21579 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT1P21579 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT1P21579 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT1P21579 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT1P21579 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT1P21579 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT1P21579 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT1P21579 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT1P21579 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT1P21579 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT1P21579 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT1P21579 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT1P21579 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT1P21579 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT1P21579 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT1P21579 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT1P21579 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT1P21579 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT1P21579 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT1P21579 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT1P21579 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT1P21579 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT1P21579 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT1P21579 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT1P21579 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT1P21579 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT1P21579 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT1P21579 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT1P21579 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT1P21579 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT1P21579 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT1P21579 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT1P21579 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT1P21579 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT1P21579 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT1P21579 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT1P21579 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT1P21579 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT1P21579 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT1P21579 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT1P21579 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT1P21579 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT1P21579 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT1P21579 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT1P21579 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT1P21579 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT1P21579 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT1P21579 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT1P21579 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT1P21579 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT1P21579 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT1P21579 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT1P21579 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT1P21579 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT1P21579 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT1P21579 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT1P21579 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT1P21579 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT1P21579 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT1P21579 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT1P21579 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT1P21579 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT1P21579 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT1P21579 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT1P21579 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT1P21579 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT1P21579 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT1P21579 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT1P21579 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT1P21579 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT1P21579 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT1P21579 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT1P21579 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms