Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POLR2CP19387 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms