Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ESRRAP11474 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ESRRAP11474 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ESRRAP11474 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ESRRAP11474 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ESRRAP11474 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ESRRAP11474 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ESRRAP11474 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ESRRAP11474 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ESRRAP11474 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ESRRAP11474 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ESRRAP11474 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ESRRAP11474 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ESRRAP11474 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ESRRAP11474 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ESRRAP11474 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ESRRAP11474 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ESRRAP11474 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ESRRAP11474 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ESRRAP11474 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ESRRAP11474 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ESRRAP11474 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ESRRAP11474 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ESRRAP11474 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ESRRAP11474 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ESRRAP11474 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ESRRAP11474 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ESRRAP11474 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ESRRAP11474 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ESRRAP11474 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ESRRAP11474 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ESRRAP11474 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms