Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMC1P11047 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LAMC1P11047 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.08
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