Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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PTPRCP08575 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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PTPRCP08575 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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PTPRCP08575 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
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PTPRCP08575 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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PTPRCP08575 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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PTPRCP08575 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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PTPRCP08575 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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PTPRCP08575 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRCP08575 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
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PTPRCP08575 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
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PTPRCP08575 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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PTPRCP08575 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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PTPRCP08575 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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PTPRCP08575 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRCP08575 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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