Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTNP04004 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTNP04004 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTNP04004 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTNP04004 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VTNP04004 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTNP04004 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTNP04004 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTNP04004 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTNP04004 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTNP04004 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTNP04004 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTNP04004 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTNP04004 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTNP04004 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTNP04004 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTNP04004 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTNP04004 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VTNP04004 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTNP04004 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTNP04004 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTNP04004 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTNP04004 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VTNP04004 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTNP04004 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VTNP04004 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTNP04004 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTNP04004 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTNP04004 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTNP04004 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTNP04004 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTNP04004 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTNP04004 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTNP04004 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VTNP04004 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VTNP04004 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VTNP04004 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VTNP04004 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VTNP04004 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VTNP04004 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VTNP04004 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VTNP04004 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VTNP04004 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VTNP04004 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VTNP04004 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VTNP04004 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VTNP04004 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VTNP04004 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VTNP04004 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VTNP04004 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VTNP04004 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VTNP04004 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VTNP04004 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VTNP04004 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VTNP04004 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VTNP04004 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VTNP04004 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VTNP04004 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VTNP04004 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VTNP04004 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VTNP04004 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VTNP04004 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VTNP04004 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VTNP04004 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VTNP04004 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VTNP04004 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VTNP04004 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VTNP04004 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VTNP04004 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VTNP04004 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VTNP04004 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VTNP04004 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VTNP04004 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VTNP04004 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VTNP04004 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VTNP04004 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VTNP04004 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VTNP04004 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VTNP04004 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VTNP04004 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VTNP04004 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VTNP04004 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VTNP04004 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VTNP04004 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VTNP04004 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VTNP04004 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VTNP04004 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VTNP04004 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VTNP04004 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VTNP04004 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VTNP04004 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VTNP04004 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VTNP04004 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VTNP04004 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VTNP04004 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VTNP04004 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VTNP04004 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VTNP04004 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VTNP04004 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VTNP04004 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms