Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms