Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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SEC24DO94855 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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