Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms