Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms