Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CACNA1GO43497 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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