Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF1O43189 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF1O43189 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHF1O43189 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF1O43189 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF1O43189 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF1O43189 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF1O43189 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF1O43189 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF1O43189 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF1O43189 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF1O43189 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF1O43189 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF1O43189 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF1O43189 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF1O43189 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF1O43189 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF1O43189 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF1O43189 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF1O43189 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF1O43189 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF1O43189 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF1O43189 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF1O43189 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF1O43189 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF1O43189 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF1O43189 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF1O43189 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF1O43189 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF1O43189 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF1O43189 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF1O43189 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF1O43189 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF1O43189 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF1O43189 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF1O43189 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF1O43189 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF1O43189 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF1O43189 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF1O43189 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF1O43189 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF1O43189 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF1O43189 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF1O43189 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF1O43189 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF1O43189 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF1O43189 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF1O43189 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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PHF1O43189 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHF1O43189 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF1O43189 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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PHF1O43189 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF1O43189 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF1O43189 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF1O43189 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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PHF1O43189 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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PHF1O43189 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF1O43189 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF1O43189 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF1O43189 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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PHF1O43189 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF1O43189 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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PHF1O43189 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF1O43189 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF1O43189 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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PHF1O43189 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF1O43189 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF1O43189 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF1O43189 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF1O43189 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF1O43189 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF1O43189 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF1O43189 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF1O43189 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF1O43189 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF1O43189 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF1O43189 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF1O43189 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF1O43189 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF1O43189 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF1O43189 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF1O43189 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF1O43189 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF1O43189 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF1O43189 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF1O43189 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF1O43189 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF1O43189 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF1O43189 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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