Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SMIM1B2RUZ4 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SMIM1B2RUZ4 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SMIM1B2RUZ4 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SMIM1B2RUZ4 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SMIM1B2RUZ4 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SMIM1B2RUZ4 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SMIM1B2RUZ4 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SMIM1B2RUZ4 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SMIM1B2RUZ4 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SMIM1B2RUZ4 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM1B2RUZ4 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM1B2RUZ4 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM1B2RUZ4 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM1B2RUZ4 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM1B2RUZ4 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM1B2RUZ4 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM1B2RUZ4 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM1B2RUZ4 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM1B2RUZ4 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM1B2RUZ4 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM1B2RUZ4 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM1B2RUZ4 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM1B2RUZ4 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM1B2RUZ4 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM1B2RUZ4 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM1B2RUZ4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM1B2RUZ4 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM1B2RUZ4 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM1B2RUZ4 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM1B2RUZ4 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM1B2RUZ4 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM1B2RUZ4 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM1B2RUZ4 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM1B2RUZ4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM1B2RUZ4 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM1B2RUZ4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM1B2RUZ4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM1B2RUZ4 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM1B2RUZ4 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM1B2RUZ4 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM1B2RUZ4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM1B2RUZ4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM1B2RUZ4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM1B2RUZ4 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SMIM1B2RUZ4 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms