Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSDA5PKW4 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms