Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
XIRP2A4UGR9 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms