Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PIPSLA2A3N6 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms