Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms