Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHANK2Q9UPX8 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHANK2Q9UPX8 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SHANK2Q9UPX8 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SHANK2Q9UPX8 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHANK2Q9UPX8 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHANK2Q9UPX8 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHANK2Q9UPX8 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHANK2Q9UPX8 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHANK2Q9UPX8 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHANK2Q9UPX8 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHANK2Q9UPX8 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHANK2Q9UPX8 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHANK2Q9UPX8 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHANK2Q9UPX8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHANK2Q9UPX8 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHANK2Q9UPX8 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHANK2Q9UPX8 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHANK2Q9UPX8 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHANK2Q9UPX8 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SHANK2Q9UPX8 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SHANK2Q9UPX8 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHANK2Q9UPX8 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SHANK2Q9UPX8 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHANK2Q9UPX8 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHANK2Q9UPX8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHANK2Q9UPX8 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHANK2Q9UPX8 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHANK2Q9UPX8 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHANK2Q9UPX8 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHANK2Q9UPX8 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SHANK2Q9UPX8 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SHANK2Q9UPX8 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms