Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRAPPC2LQ9UL33 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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