Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM1

PEMT, Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEMTQ9UBM1 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PEMTQ9UBM1 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms