Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF9Q9P2J2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
IGSF9Q9P2J2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
IGSF9Q9P2J2 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
IGSF9Q9P2J2 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IGSF9Q9P2J2 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms