Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP36Q9P275 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms